平臺主要功能是把握國家農業和食品產業發展戰略，瞄準國際農產品質量安全工程技術前沿，結合上海市中長期建設規劃，迎合上海市國際化、城市化對農產品質量安全的重大科技需求，集中圍繞農產品質量安全風險評估工程技術，開展農產品生產源頭控制、農產品生產健康和環境安全性綜合評價、農產品檢驗檢測、農產品安全預警、農產品產地溯源、農產品安全應急追溯、農產品營養功能評價等多層次、多環節、多學科技術融合的技術研發中心，打造國內領先、國際一流的農產品質量安全科技創新、成果轉化、公益服務和信息咨詢的食品安全相關工程技術研究中心。

平臺近年來承擔了農業部、上海市農業委員會、上海市食品藥品監督管理局等部門下達的各類農產品、農業投入品的質量安全抽查、普查和監測任務。研究所的研究方向包括：農產品質量安全標準、檢測技術、控制技術和風險評估研究等，近年來主持和參加了30多項國家標準、行業標準及地方標準制修訂，取得科技成果50余項；發表論文160余篇；與多家國外研究機構建立了密切的合作關系。